Entrez

Entrez è un sistema disponibile via web per la ricerca e l’estrazione di dati da banche dati di sequenze nucleotidiche o proteiche, dalla banca dati bibliografica Meline, dalla banca dati delle malattie mendeliane OMIM, o da risorse gnomiche. Tramite Entrez è anche possibile esplorare la classificazione degli organismi come riportata in Taxonomy o su ogni altra banca dati specializzata sviluppata all’NCBI.

Entrez, a differenza di SRS, è una shell chiusa in cui non è possibile scaricare via internet, o ottenere un software che gestisce l’intero sistema, né è possibile duplicare il sito su altri computer, né installare proprie banche dati personali. Per effettuare la ricerca bisogna scegliere una categoria e poi usare gli operatori logici AND, OR, BUT NOT.

Si può usare la funzione Limits per limitare la ricerca ad alcuni criteri. Il comando History visualizza tutti i risultati di una query relativi ad una categoria, che possono essere salvati col comando text.

Entrez è usato soprattutto da ricercatori in quanto è un sistema di riferimento per la ricerca bibliografica sulla banca dati Medline che è la più completa banca dati bibliografica del settore bio-medico. L’NCBI ha incorporato Medline in Entrez chiamando il nuovo sistema formato da Entrez + Meline: PubMed. Poiché moltissime banche dati hanno il cross-referencing a Medline è sempre possibile consultare la letteratura correlata ai dati biologici annotati nelle banche dati specializzate.

La homepage di Entrez: