RISORSE GENOMICHE

Con l’avanzare dei progetti genomici, la bioinformatica ha avuto un forte impulso e quindi uno sviluppo di risorse genomiche accessibili più o meno liberamente in rete. Le risorse genomiche sono siti in cui è possibile reperire dati relativi al sequenziamento genomico e al mappaggio. Le risorse possono essere:

• risorse integrate dove sono disponibili dati relativi a tutti i genomi attualmente in fase di studio;
• risorse relative ai genomi di specifiche categorie di organismi dove sono raccolti tutti i dati genomici dei Batteri;
• risorse organismo specifiche quali MGD per il topo, RGD per il ratto, GDB per l'uomo e altri ancora. Una caratteristica comune a tutti questi siti è la possibilità di scaricarsi sul proprio computer le sequenze dell'intero genoma o di parti di esse, inoltre è sempre possibile effettuare ricerche di similarità di sequenza contro l'intero genoma o parti di esso mediante l'applicazione dei metodi FASTA e/o BLAST.

In tale contesto il sistema più rilevante è Ensembl, sviluppato per la raccolta dei dati relativi alle annotazioni del genoma umano. Annotare un genoma significa caratterizzare le sue funzioni attraverso la ricerca di dati già determinati oppure applicando metodologie bioinformatiche che consentano di caratterizzare nuove funzioni e proprietà.
  Un altro sistema che può essere preso a riferimento è HumGuide, attraverso il quale è possibile eseguire un’analisi dettagliata delle risorse riguardanti il Progetto genoma umano.