INTRODUZIONE

Uno dei primi scopi della biologia computazionale consiste nel rispondere alla domanda: data una nuova sequenza, cosa si può dire sulla funzione, o sulle funzioni, in essa codificata?
Sono disponibili vari strumenti, ognuno caratterizzato da limiti di applicabilità e affidabilità ben precisi. Il più valido strumento attualmente a disposizione è una ricerca per similarità di sequenza in una banca dati di acidi nucleici o di proteine (vista nel capitolo precedente). Se tale ricerca non porta all'identificazione di geni o proteine simili e già caratterizzati, bisogna necessariamente utilizzare altri strumenti, altrettanto potenti anche se talvolta, meno affidabili: la ricerca di pattern e di motivi funzionali.
La ricerca di pattern (pattern recognition) è un'importante area di ricerca dell'informatica e della fisica applicata. Tale branca di ricerca studia l'organizzazione e il disegno di sistemi che riconoscano motivi e regolarità nei dati a disposizione.


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