ESEMPIO

SA= E V D Q K I S K W D
SB= E V K K I T R P K W D
E V D Q K I - - S K W D
| |     | |       | | |
E V - K K I T R P K W D
allineamento
match
gap
mismatch

[ 1 2 3 4 5 6 7 8 9 10 11 12 13 14 15 16 17 18 19 20 21 22 23 24 25 26 27 28 29 30 31 32 33 34 35 36 37 38 39 40 41 42 43 44 45 46  ]